I middelalderens Japan arbeidet ninjaer som leiemordere og spioner.
De ble hyret av adelsmenn blant annet til å utføre spionasje, sabotasje og hemmelige angrep.
Ninjaer hadde dårlig rykte
I motsetning til samuraiene, som levde og kjempet etter en streng æreskodeks, opererte ninjaene i det skjulte. De hadde derfor dårlig rykte, og ble sett på med forakt.
Bruken av ninjaer forsvant i løpet av 1600-tallet, da Japan ble forent etter flere hundre år med borgerkrig.